Lilly Funke (Tatjana Kästel) ist Hauptkommissarin und seit Oktober 2023 Leiterin der SOKO Köln. Gespielt wird sie von Tatjana Kästel, die schon 2014 in einer Gastrolle als Lena Greiss in der Serie zu sehen war. Als Kommissarin Lilly Funke kam sie im Herbst 2016 zum Auftakt von Staffel 15 ins Team, nur eine Woche nach der neuen Chefin Anna Maiwald.
Lilly gilt als pfiffig, engagiert und einfühlsam. Bei Angehörigen und Zeugen findet sie oft den richtigen Ton, ohne den Fall aus den Augen zu verlieren. Mit Matti Wagner, Jonas Fischer und Vanessa Haas bildet sie seit Jahren den festen Kern der Ermittler.
Gleich in ihren ersten Episoden holt Lilly die eigene Vergangenheit ein. In „Im Zwielicht“ wird der Leiter der Drogenfahndung erschossen in einem Hotelzimmer gefunden, neben ihm liegt Lilly mit der Waffe in der Hand. Der Tote ist Falk Sontheimer, mit dem sie früher eine Affäre hatte.
Die Kollegen müssen Lilly noch am Tatort festnehmen. Anna Maiwald und Matti kämpfen danach um den Beweis ihrer Unschuld und stoßen auf zwei Ermittler, die mit einem Drogenhändler gemeinsame Sache machen könnten. Lilly selbst gerät an die Witwe Kristin Sontheimer, die zunächst ihre Nähe sucht und sie dann angreift.
Unter Anna Maiwald und später Helena Jung wächst Lilly zur erfahrenen Ermittlerin heran. Sie übernimmt mehr Verantwortung und ist für die Jüngeren im Team eine wichtige Ansprechpartnerin.
Spoiler: Die Chefin aus den eigenen Reihen
Als Helena das Team zum Auftakt von Staffel 22 verlässt, soll die Nachfolge aus den eigenen Reihen kommen. Lilly übernimmt die Leitung zunächst kommissarisch. Bei einem Fall, in dem sie mit Jonas den Hinweisen einer Schnitzeljagd folgt, werden die beiden zu Konkurrenten, und es geht um mehr als den Täter.
Am Ende setzt sich Lilly durch und führt die SOKO seit dem 24. Oktober 2023 als Hauptkommissarin. Kurz darauf stößt Anfang 2024 die junge Kommissarin Amira Mahdi dazu, seit Staffel 23 gehört Rechtsmedizinerin Dr. Pilar Westphal zum Team.
Auch als Chefin ermittelt Lilly selbst mit. In „Scherben bringen Unglück“ steht sie mit Amira am Rheinufer vor der toten Archäologin Christine Sperling, die fest an ein römisches Amphitheater in Köln geglaubt hatte.
Tatjana Kästel spielt die Rolle von Lilly Funke in der Serie SOKO Köln seit 2016.