Die drei Evangelion-Piloten werden einem Synchronisations-Test unterzogen, als ein aus Millionen von Mikro-Organismen bestehender Engel angreift und anfängt, den dreiteiligen Bio-Computer MAGI zu hacken. Dr. Ritsuko Akagi gelingt es, ihn vorerst aufzuhalten, doch sollte der Engel erneut die Kontrolle erlangen, könnte er den Selbstzerstörungsbefehl geben und das Hauptquartier zerstören. Sie muss deshalb Tief in den von ihrer Mutter gebauten Supercomputer eintauchen, um eine Lösung für das Problem zu finden.

Was bedeutet eigentlich „TBA“ in der Anzeige bei Episodenführern?