Auch wenn Marlon Wayans' Eltern rein gar nichts mit dem Showgeschäft zu tun hatten, wurden er und die meisten seiner neun Geschwister Schauspieler, Comedians, Autoren oder Produzenten. Auch einige seiner zahlreichen Nichten und Neffen sind mittlerweile bekannt, so wie Damon Wayans Jr. (New Girl).
Marlon Wayans startet seine Karriere in den Produktionen seiner älteren Geschwister und ist 1992-1993 in der Sketch-Show von Keenen Ivory Wayans, In Living Color, dabei. 1995-1999 spielt er gemeinsam mit Bruder Shawn Wayans die Hauptrollen in der Sitcom „The Wayans Bros.". Auch auf der Kinoleinwand sieht man den Darsteller, unter anderem 2000 in „Requiem for a Dream“, „Scary Movie“ oder 2004 in „White Chicks“.
In der Netflix-Filmproduktion „Naked“ spielt er 2017 neben Regina Hall die Hauptrolle. Ebenfalls 2017 startet Wayans' Comedyserie Marlon auf NBC.
2019 wird er sechs verschiedene Rollen in dem Netflix-Film „Sextuplets“ spielen.
Seit 2005 ist Marlon Wayans mit Angelica Zackary verheiratet. Die beiden sind Eltern von Sohn Shaw Howell und Tochter Amai Zackary.