Während Asuka in Depression verfällt und Misato um Kaji trauert, greift ein weiterer Engel an, der versucht, körperlich und geistig mit Rei zu verschmelzen. Um zu verhindern, dass das Gleiche mit Shinji geschieht, opfert sie sich und EVA-00, indem sie die Selbstzerstörung aktiviert. Dabei wird auch ein Großteil der Stadt in der Explosion zerstört. Kurz darauf staunt Shinji nicht schlecht, als eine weitere Rei mehr oder weniger wohlauf im Krankenhaus auftaucht. Im Hauptquartier enthüllt Ritsuko schließlich die Wahrheit über Rei und das Dummy-Plug-System.

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